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人類對自身問題的認識和解決，將在本世紀內取得重大突破。科學出版社已經將醫藥衛生領域的圖書出版，特別是醫學學術科研成果的交流、引進，祖國傳統醫學的傳承、發展，作為重要的、前景廣闊的出版業務，加大力度，加大投入，優先發展。

多年來，科學出版社已經形成了從基礎醫學，到臨床醫學、預防醫學，以及藥學和特種醫學的覆蓋現代醫學各大門類的學術著作出版架構。不僅出版了《肝炎病毒·分子生物學叢書》、《協和手術要點難點及對策》叢書、《神經系統單基因病診斷學》、《臨床癥狀鑒別診斷叢書》、《現代臨床影像學叢書》、《臨床醫師診療叢書》、《今日臨床叢書》、《現代骨科學》、《臨床檢驗裝備大全》、《數字衛生叢書》、《臨床護理指南叢書》等系列專著和手冊，而且在內科、外科、骨科、婦科、兒科、眼科、口腔科、皮膚科、神經科、影像/放射科，以及藥學、營養學、衛生學、法醫學、檢驗、醫藥管理等各個科/門類都有精品力作。如《臨床超聲心動圖學》、《實用臨床麻醉學》、《臨床血管外科學》、《實用臨床介入診療學圖解》、《白血病治療學》、《食管癌大體標準圖集》、《臨床生殖內分泌與不育癥》、《胎兒畸形產前超聲診斷學》、《穿支皮瓣的應用解剖與臨床》、《神經外科手術學》、《臨床視光學》、《皮膚科治療學》、《皮膚病彩色圖譜》、《臨床營養學》、《臨床中樞神經解剖學》、《藥物毒理學》、《生物技術藥物研究開發和質量控制》、《實用法醫學》等。

為學習和借鑒國際先進的醫療科技，科學出版社還引進和翻譯了一大批廣受好評的國外經典醫學著作。如《安德魯斯臨床皮膚病學》、《貝塞斯達臨床腫瘤學手冊》、《介入腎臟病學》、《臨床影像鑒別診斷圖譜》、《實用骨科影像學》、《麻省總醫院臨床麻醉手冊》、《癌癥化療手冊》、《臨床研究規范與準則》等。

祖國傳統醫藥學為人類的生存與發展做出了不可磨滅的重要貢獻。科學出版社一直致力于廣泛傳播和充分利用中醫藥文化資源，從學術思想、臨床經驗、醫德醫風三個方面傳承和弘揚這一人類健康寶庫中的瑰寶，出版了《國醫大師臨床研究》和《<本草綱目>研究集成》兩部大型專著叢書，以及《清宮醫案集成》、《中醫濕病證治學》和《分子生藥學》等高端學術著作。

為培養醫藥學人才，提高全民族的健康水平，科學出版社同時也出版大批的醫藥學教材教輔、醫學考試用書和醫藥學科普讀物。